1. Natsuko為什麼要進塔？Himi很清楚她來的理由和她在哪，但是她完全不解釋。

2. 石棺之主是誰？ Kiriko和Himi都跟他溝通過，而且很明顯不是塔主，那會是誰？

3. Kiriko的時間線： 3-1) 為什麼婆婆Kiriko明明一起沉下去了，但沒有跟主角一起出現而是直接變人偶？ 3-2) 年輕Kiriko為什麼知道其他婆婆的存在？ 3-3) 為什麼結局時婆婆Kiriko要過一段時間才從人偶變回來，鳥兒們卻馬上變回去？

其他小問題： 婆婆Kiriko在主角進塔時說只有有塔主血脈的人能聽見塔主的聲音，我一開始以為蒼鷺就是塔主，但後來馬上發現不是，那她到底聽不聽得到蒼鷺的聲音？

蒼鷺是塔主的僕人嗎？他是哪個世界來的？為什麼能變身？

鐵匠被吃掉了QQ但他是誰？

產房是啥？禁忌是啥？風哪來的？

塔主所在的地方，以及他的鳥兒居民和原住民們住的地方是用一個的長廊連接的，塔主的地方(左)是發白光，而外面(右)發黑光。我們在電影裡看過三次塔主地方，三次內容都不一樣。第一次是在主角的夢中，那裡是沒有背景的純白。第二次是鸚鵡王的到來，那裡是鸚鵡的天堂。第三次是主角和蒼鷺的到來，那裡是日式宅院。可以推測說，塔主地方會以到來者所心念為不同的具象，基本上就是Homestuck的夢泡沫。